Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem52bQ0VBF2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms