Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r181Q0P547 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r181Q0P547 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms