Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ubxn2bQ0KL01 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubxn2bQ0KL01 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms