Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp2Q08652 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp2Q08652 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms