Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SctQ08535 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SctQ08535 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SctQ08535 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SctQ08535 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SctQ08535 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SctQ08535 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SctQ08535 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SctQ08535 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SctQ08535 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SctQ08535 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SctQ08535 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SctQ08535 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SctQ08535 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SctQ08535 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SctQ08535 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SctQ08535 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SctQ08535 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SctQ08535 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SctQ08535 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms