Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tff1Q08423 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tff1Q08423 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms