Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cnn1Q08091 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn1Q08091 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn1Q08091 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cnn1Q08091 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cnn1Q08091 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cnn1Q08091 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnn1Q08091 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Cnn1Q08091 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cnn1Q08091 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn1Q08091 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn1Q08091 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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