Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col9a2Q07643 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col9a2Q07643 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms