Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdx4Q07424 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdx4Q07424 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms