Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Caprin2Q05A80 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms