Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnal1Q05A62 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms