Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprgQ05909 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprgQ05909 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms