Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs3Q05895 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs3Q05895 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms