Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Fmn1Q05860 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Fmn1Q05860 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fmn1Q05860 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms