Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox12Q04890 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox12Q04890 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox12Q04890 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms