Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nf1Q04690 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Nf1Q04690 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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