Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tff2Q03404 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms