Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms