Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ly9Q01965 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms