Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VcpQ01853 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VcpQ01853 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms