Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbp1Q01514 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp1Q01514 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms