Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gja5Q01231 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja5Q01231 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja5Q01231 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms