Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms