Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gjb2Q00977 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms