Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp4Q00724 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp4Q00724 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms