Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SeleQ00690 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SeleQ00690 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SeleQ00690 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SeleQ00690 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SeleQ00690 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SeleQ00690 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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