Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabpb1Q00420 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabpb1Q00420 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms