Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax8Q00288 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms