Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms