Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb4P99026 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb4P99026 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms