Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cds1P98191 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cds1P98191 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms