Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbbp6P97868 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbbp6P97868 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp6P97868 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms