Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms