Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas1P97459 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Npas1P97459 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas1P97459 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas1P97459 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Npas1P97459 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms