Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smyd1P97443 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smyd1P97443 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smyd1P97443 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms