Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nbr1P97432 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nbr1P97432 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms