Protein–RNA interactions for Protein: P86792

Ccl21b, C-C motif chemokine 21b, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21bP86792 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl21bP86792 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl21bP86792 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms