Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubg1P83887 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg1P83887 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms