Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcaP82350 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcaP82350 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcaP82350 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcaP82350 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcaP82350 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcaP82350 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgcaP82350 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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