Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx2P81066 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx2P81066 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx2P81066 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms