Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Polr1bP70700 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms