Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dlx4P70436 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dlx4P70436 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms