Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad1P70340 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms