Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frat1P70339 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frat1P70339 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frat1P70339 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frat1P70339 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms