Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms