Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf6P70196 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf6P70196 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf6P70196 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf6P70196 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms