Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrig1P70193 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms