Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SbdsP70122 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SbdsP70122 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SbdsP70122 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SbdsP70122 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SbdsP70122 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SbdsP70122 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SbdsP70122 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SbdsP70122 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms