Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabrb3P63080 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms