Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx1P63013 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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